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把显微镜所揭示的最微小的奇迹看作上帝的证明。
1726年，瑞士自然科学家约翰·雅各布·施赫泽（JohannJakobScheuchzer）认为蝾螈化石是在大洪水中丧生的罪人的遗骸。
新的物理学被调动起来，从自然角度解释《圣经》中的奇迹。
保拉纳神父皮埃尔·伽桑狄（PierreGassendi，1592—1655）是捍卫伊壁鸠鲁原子论的重要人物，他提出，小号声音引发的空气振动是导致耶里哥[75]的城墙崩塌的原因。
方济各会修士巴塞洛缪·马斯特里（BartolomeoMastri，1602—1673）和博纳文图拉·贝鲁提（BouraBelluti，15991600—1676）居然试图重新引入精神智慧，以便解释行星的螺旋运动。
他们提供了希腊、阿拉伯和经院的权威著作作为证据，其中包括迈克尔·司各脱翻译的努尔·艾德丁的作品。
艾德丁和其他可援引的古代权威脱离旧轨道，却又迷失在岔道上。
这些人在伽利略的《关于两大世界体系的对话》中被无情嘲讽：亚里士多德没有遭到蔑视，伽利略很尊敬他，但追随他的那群画虎不成反类犬的学者无一逃脱。
德国人戈特弗里德·威廉·莱布尼茨（1646—1716）反对笛卡儿的物理学和斯宾诺莎的神学，提出了另一种与之前都不同的思想模式。
他将笛卡儿的固定粒子变成有生命有灵魂的“单子”
，想以此把上帝重新引入世界。
“单子”
是永生的，不会扩展也没有形状，它们能够感知并渴望改变状态。
上帝把“单子”
设定为永恒的，这样在“单子”
和物体运动之间就出现一种平行关系，就像精确调整的同步机器，这就是他著名的“前定和谐”
理论。
优秀完美的造物主从无数可想象的宇宙中只选择了“所有可能世界中最好的”
一个并帮它成为现实。
在这个世界中发生的一切肯定都是为一个好的结局服务——甚至包括邪恶，没有它的存在就无法想象善良。
与笛卡儿一样，莱布尼茨对理性的力量充满信心。
他孜孜不倦地想发明一种通用语言，这种语言可以跨越国界让人们相互理解，同时寻求政治和宗教平等。
“理性”
成为即将来临的启蒙的神奇咒语。
另一个是“批判”
，它是皮浪和蒙田的遗产。
莱布尼茨同时代的皮埃尔·培尔（PierreBayle，1647—1706）沿袭了批判的传统，他也是莱布尼茨的对手。
一个试图构建一种似乎能与基督教世界观兼容的宇宙学说，另一个则对“前定和谐”
概念深表怀疑。
培尔对神义论问题的回应不仅激进，而且近乎异端。
他的观点似乎与摩尼教和清洁派有联系，认为恶与善一样必须是首要强势原则。
但培尔和莱布尼茨都看到，关于真正和纯粹的信仰的争论已经升级为危机，走出危机的唯一出路就是理性和泛基督教主义。
在所有哲学推测的另一边，艾萨克·牛顿（1643—1727）已经完成自然科学革命。
1697年，他出版了《自然哲学的数学原理》，并在第二版中添加了“总释”
，经典物理学以此创立，直到相对论和量子力学时代依然被认为是完全有效的。
对于牛顿来说，方法就是怀疑一切在实验和观察中无法确认的东西。
然而他与笛卡儿不同，他完全依靠数学创立了自然科学。
他构思的空间是无限的，就像时间一样绝对，而且是空洞的。
驱使粒子运动和粒子形成的物体的力，被牛顿总结成为简单定律。
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