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事实上，在共和国时期，已经有一些否定学术自由的事件发生。
罗马侵占希腊以后，由于希腊人文化发展水平很高，罗马人不得不向他们学习，许多希腊人在罗马人的学校里教书。
但是，他们的教学内容受到限制，与原来相比，他们被迫收敛了锋芒。
在希腊，他们教授哲学，而在罗马，他们只能教授逻辑，因为哲学可能会触及时政，而逻辑则不会。
公元前170年，希腊斯多葛派哲学家和文法学家克莱特（Crates）来罗马讲学，引起贵族保守派的反对。
公元前161年，元老院的法令将哲学教师和拉丁语雄辩术教师逐出罗马。
在帝国皇帝韦帕芗（Vespasianus）统治时期（公元69—79年），国家开始由国库支付一部分文法教师和修辞教师的薪俸。
这是国家对教育的支持，也是国家加强对教育控制的信号。
公元92年，罗马检察官下令查禁一些拉丁语雄辩术教师，把他们的教学看作与国家的传统不相容的异端。
[7]以后，教师在经济和社会地位方面陆续获得了一些特权，这也意味着他们不得不同时放弃在学术方面的部分权利。
到公元425年，设立学校的权利被收归帝国所有。
帝国对待基督教的态度，也反映出当时学术自由的一些状况。
在耶稣时代及以后300年中，信仰和传播基督教是非法的，甚至会受到镇压。
公元313年，君士坦丁（e）皇帝颁布“米兰赦令”
，宣布基督教徒信仰自由。
公元392年狄奥多西（Theodosius）皇帝又将基督教定为国教，并禁止其他宗教。
公元529年，东罗马皇帝查士丁尼安（Justinianus）下令关闭了柏拉图学园和雅典的其他哲学学园，因为这些学园的研究和教学与基督教精神不符。
基督教一旦取得合法地位，立即获得了独霸人们精神世界的权力。
在基督教的权力范围内，信仰和宣传非基督教思想非常危险。
在基督教教育中，尽管继承了一些希腊、罗马的教育遗产（比如“自由七艺”
），但它们都是为学习《圣经》服务的，哲学及其他学科是神学的婢女。
基督教会接受了耶稣的“你将掌握真理，同时真理将使你自由”
的箴言，但并没有同时把自由当作探索真理的手段。
尽管《圣经》说：“智慧必入你心，你的灵魂要以知识为美。”
（《圣经·旧约·箴言》第二章第十节）但《圣经》又说：“敬畏耶和华是智慧的开端，认识至圣者便是聪明。”
（《圣经·旧约·箴言》第九章第十节）“你要专心依赖耶和华，不可依靠自己的聪明，在你一切所行的事上，都要认定他，他必指引你的路。”
（《圣经·旧约·箴言》第三章第五、六节）
早期的基督教教学手册告诫人们，不要看异教书籍，不要听“错误”
的预言。
到13世纪，在多明我会（Domini）的学者和经院哲学家阿奎那（St.ThomasAquinas）的努力下，天主教会终于成功地把基督教理论和希腊哲学综合在一起，基督教思想归于统一。
但没过几个世纪，马丁·路德（MartinLuther）又在寻求宣传一种“异端”
学说的自由，形成了受到罗马教廷严厉反对的新教。
由于得到世俗诸侯的帮助，路德面对反对仍保持了自由。
为了防止“滥用”
这一自由，教会和国家插手新教地区，将路德的“异端”
上升为一种新的正统思想，以“保护”
教师和学生不受异教的影响。
在反对宗教改革的过程中，耶稣会（SocietasJasu）坚持了对其控制的教育的严格限制。
它的教材由大主教审查，不合正统的观念不得进入教材。
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